1、生物除磷需要创造一个适合聚磷菌生长的自然环境，从而使聚磷菌得以大量繁殖。在工艺技术方面，可以设置厌氧、好氧交替的自然环境条件，以提高聚磷菌的选择性。首先，厌氧区必须调节严格的厌氧环境，这与聚磷菌的生长状况、释放磷的能力及利用有机底物合成PBH的能力有关。另一方面，好氧区必须提供充足的溶解氧，为使聚磷菌溶解储存的PHB并挥发出足够的动力供其过量的磷吸收，便于有效地消化废水中的磷。一般厌氧段DO应严格控制在0.2mg/L以下，厌氧段DO应调节在2mg/L以上。

2、在厌氧阶段当硝酸盐存在时，反硝化菌与聚磷酸菌竞争，优先利用底物中的甲酸、乙酸、丙酸等低分子量有机酸，聚磷酸菌处于劣势，限制了聚磷酸菌的磷挥发。只有当污水中聚磷酸菌所需低分子量脂肪酸的量足够时，硝酸盐的存在才不会影响除磷的实际效果。

3、污水生物除磷好氧池适宜pH为6～8。保持污水中一定的碱度，起调节作用，能使pH保持稳定。为使好氧池pH保持中性附近，池内总碱度应高于70mg/L。

4、聚磷菌在厌氧释磷时，会消化可溶性有机物并贮存在菌体内。若BOD5/TP比值过低，聚磷菌在释磷时不能有效地消化并贮存可溶性有机物，进而影响其好氧吸磷，降低除磷效果。一般认为，渗出水BOD5/TP高于15时才能达到理想的除磷效果。因此，可采用部分渗出、绕过初沉池的方法来获得除磷所需的BOD5。

5、生物除磷主要通过去除剩余污泥来实现，因此剩余污泥的量会影响实际除磷效果，泥龄短的系统产生的剩余污泥较多，可以达到较高的实际除磷效果。

6、一般来说，温度在10~30℃之间就能达到良好的除磷效果。